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2012年7月25日，南宁东站动工建设；2014年12月26日，南宁东站投入运营；2015年9月12日，南宁东站南广场投入使用。2024年12月30日，该站随南宁至珠海高铁南宁至玉林段开通运营。

截至2017年1月，南宁东站总建筑面积为267471平方米；截至2023年8月，南宁东站站台规模为13台30线。

票务服务

截至2017年6月，南宁东站设置了90台自动售（取）票机，分布在候车大厅各个区域。

设备设施

公安制证

截至2014年11月，南宁东站设有公安临时办证系统，方便无有效证件的旅客办理购票。

停车设施

截至2017年6月，南宁东站的南北广场分别设有特大型地下停车场，可同时满足4200多辆社会车辆、250多辆出租车停放需求；截至2019年7月，南宁东站社会停车场系统升级改造，出入场方式均实现车辆自动识别无须取卡，缴费方式变为人工收费与手机微信支付相结合形式。

亲子卫生间

截至2019年2月，南宁东站设置有亲子卫生间设施，内设儿童安全座椅和婴儿护理台，解决了带儿童出行的旅客的如厕难题。

报警牌

截至2019年2月，南宁东站张贴有报警牌，标注定位编号，方便旅客及时求助。

行李寄存

截至2020年10月，南宁东站各个进站口都有一排自助存包柜；需要寄存行李较大的旅客，还可以在候车厅西南角人工行李寄存的店面办理相关业务。

充电服务

截至2020年10月，南宁东站候车室内设置有充电插座，旅客们可以免费使用。

便民就餐区

截至2020年10月，南宁东站东南和西北角设置有便民就餐区，便于旅客在赶车途中用餐。

行李小推车

截至2020年10月，南宁东站候车区内有行李小推车，供行李较多的旅客在高架候车区使用。

运输流量

2018年10月1日，南宁东站发送旅客83700人。

2019年，南宁东站发送旅客达21960000人，日均发送旅客超60000人。

2022年10月1日，南宁东站发送旅客110700人；12月31日，南宁东站发送旅客40500人。

2023年7月8日，南宁东站发送旅客122000人。

轨道交通

截至2023年8月，南宁东站南广场下方设有火车东站，途经线路为南宁轨道交通1号线，运营时间为06:30-23:00。

公交线路

据2024年2月南宁公交官网显示，南宁东站公交枢纽站布设公交线路25条。

出租汽车

截至2014年12月，旅客可从高架东落客平台到南宁东站东进站口进站候车。

刘三姐·南宁东服务台

南宁东站设置有“刘三姐·南宁东服务台”，为旅客推出"五心"服务，既“爱心服务台”“贴心服务队”“暖心候车区”“放心寄存处”“省心一卡通”，提供重点旅客接送服务、失物招领、解答问询、广播找人等服务，并配备了便民针线盒和非处方药品的便民小药箱。

刘三姐·南宁东站悦途爱心服务区

南宁东站候车大厅中部设置有“刘三姐·南宁东站悦途爱心服务区”，内设单间母婴哺乳室、游乐区等设施。

“为您指路”便民纸条、服务手册

南宁东站服务台设置有“为您指路”小导游便民纸条、服务手册，主要为旅客指引站内服务设施位置、周边旅游、南宁市交通等信息。

南宁东站是南宁铁路枢纽的核心，形成一个集铁路客运、轨道交通、长途汽车及城市公交等多种运输方式紧密换乘的区域综合交通枢纽体系。（南宁轨道交通集团有限责任公司 评）

南宁东站这座连接广西北部湾经济区和珠江—西江经济带的陆上交通枢纽，以及面向东南亚国家联盟的国际性交通枢纽，发挥辐射带动作用，拉动旅客增长、带动城市发展的后劲力量强劲。（《南宁日报》 评）